Olá,
As tabelas de configuração são usadas na extração de LO, quando os dados estão sendo extraídos usando LO como carga completa ou carga inicial, nesse momento só precisamos preencher as tabelas de configuração no lado do R/3, para todas as outras cargas delta os dados virão da fila delta.
Tente pesquisar no fórum com o objeto de pesquisa como tabelas de configuração, você obterá muitas informações.