Prezado Sivaji,
1. Intercompany --> As vendas entre empresas significam transferência de estoque ou vendas entre duas plantas que pertencem ao mesmo código de empresa.
2. Intraempresa --> As vendas intraempresa significam transferência de estoque ou vendas entre duas plantas que pertencem a dois códigos de empresa diferentes
Consulte este link onde você encontrará alguns documentos disponíveis sobre o processo de Intercompany e Intraempresa
http://help.sap.com/saphelp_47x200/helpdata/en/4a/ac853478616434e10000009b38f83b/frameset.htm
Espero que seja útil
Obrigado,
Murali.