Hola
Es un tanto confuso, lo que sucede es que en la versión anterior estaba el problema de que la solicitud de anticipo no se podía jalar a la hora de hacer la factura final, por ello el artificio actual que sí permite esta funcionalidad.
Si ves el asiento de la siguiente manera podrás entenderlo mejor:
Pago recibido
CAJA 1000
CUENTA DE ANTICIPO NO ASOCIADA 1000
SN (cuenta asociada por cobrar principal) 1000
CUENTA DE ANTICIPOS PROVISIONAL 1000
Hasta aquí, el anticipo lo tienes en una cuenta no asociada, pero tienes un reflejo como pago a cuenta en el SN (que se compensa con la cuenta provisional).
Este asiento adquiere sentido cuando generas la factura final.
Factura final
SN (CUENTA ASOCIADA PRINCIPAL 1770
IMPUESTO 270
VENTA 1500
CUENTA DE ANTICIPOS PROVISIONAL 1000
CTA DE ANTICIPO NO ASOCIADA 1000
Luego de esto, como verás, las cuentas temporales quedan en 0 y se aplica tu anticipo a la factura. El problema es que si lo miras antes de la factura final, ves como si el anticipo estuviese 2 veces por el artificio del que te hablo.