Gracias Mike,
He llegado a la conclusión de que no necesito abrir ese archivo JAR. Simplemente estaba haciendo doble clic en él en NWDS y esperando que se abriera.
La razón por la que lo estaba haciendo era porque estaba haciendo referencia a objetos en el EJB en mi proyecto JSP pero no aceptaba referencias a esos objetos, por lo tanto pensé que el archivo JAR corrupto era un problema.
Resulta que no había colocado la declaración "import" requerida en mi código JSP.
Bueno, hay que aprender a la mala.
¡Puntos otorgados a todos ustedes, gurús, por aguantar mi pregunta de novato!
Tristan