Hola Darío
En alguna ocasión tuve un problema similar debido a una configuración específica del cliente que estaba obstaculizando el acceso correcto a las tablas 9LR** (los conceptos habían sido modificados para incluir SPLITS) y esta funcionalidad de retroactividad requiere que todo esté sin splits. En ese momento, eso fue lo que estaba causando el problema. Quizás no sea tu caso.
Recomendaría verificar lo que dice la nota: 755939 - Implementación de la nueva funcionalidad de contabilidad retroactiva si estás implementando la funcionalidad retroactiva al principio del flujo de entrada.
Saludos
Amílcar Caballero