Encontrei algo no registro de erros...
"Exceção não tratada no loop de eventos"
java.lang.NullPointerException
at com.sap.tc.cm.ejb.modeltype.importer.service.EJBModelDetailsService.getModelClassInfos(EJBModelDetailsService.java:19)
at com.sap.tc.cm.ejb.modeltype.importer.dialog.EJBModelCreationDialog.afterEJBSelectPage(EJBModelCreationDialog.java:342)
at com.sap.tc.cm.ejb.modeltype.importer.dialog.EJBModelCreationDialog.nextPressed(EJBModelCreationDialog.java:127)
at com.sap.ide.cmi.core.internal.newmodelwizard.NewModelWizardDialog.nextPressed(NewModelWizardDialog.java:64)
...
Parece que isso é um bug grave...