Olá Wendy,
No MSP, os marcos também têm um ícone que parece indicar uma duração de zero (ou um) dia, mas é possível definir a bandeira de marco para uma tarefa de duração - digamos 5 dias - e o MSP não mudará sua duração. Ao importar para o cProjects, a duração das tarefas não é modificada. Portanto, não vejo objeções funcionais deste lado.
E quanto a problemas futuros com marcos de longa duração, também não espero problemas "funcionais" (afinal, o marco é apenas uma tarefa com uma bandeira), mas pode haver alguma confusão por parte de alguns usuários que não estão cientes dessa possibilidade e inspecionam o diagrama de Gantt e veem um marco (com seu ícone curto) que parece bloquear algum tempo...
Cumprimentos,
Thomas
