Ao trabalhar com uma ferramenta de terceiros por meio de uma interface, logicamente não é possível realizar a entrada de mercadorias no SAP, pois as entradas devem ser capturadas primeiro no sistema de terceiros transferindo os detalhes do pedido de compra do SAP e posteriormente os detalhes da entrada de mercadorias capturados serão transferidos da ferramenta de terceiros para o SAP chamando um RFC. O processo não oferece nenhuma vantagem, pelo contrário, esta é a única forma de executá-lo e assumo que você está passando informações de solicitação de pedido da ferramenta de terceiros para o SAP para criar um pedido.
A ferramenta de terceiros à qual faço referência aqui é o MAXIMO.