Creo que no estás proporcionando suficiente información, porque si reemplazas el PDF, entonces es imposible que se imprima otra cosa. Por lo tanto, deberías elaborar más.
Mi opinión: dado que estás hablando de FPCOMP, supongo que es un formulario de Adobe generado a través de los Servicios de Documentos de Adobe, por lo que tal vez el problema esté relacionado con la caché en los ADS, que todavía apunta al "diseño original". Esto ya se discutió en el foro cómo borrar la caché. Eso no explica por qué es diferente entre la vista previa y la impresión real, tal vez sea un problema de servidor de aplicaciones diferente, o lo que sea. De todos modos, borrar la caché debería resolver el problema.