Olá Bala,
Essas mensagens de erro personalizadas são para aplicativos WD personalizados e também encontrei uma maneira de personalizar páginas de erro para aplicativos que são executados em /irj/, mas não para aplicativos WD como ESS/MSS. A mensagem inicial que você mencionou provavelmente é para o encerramento de sessão de aplicativos baseados em WD, há alguma forma de personalizar as mensagens para ESS/MSS? Não acredito que tenhamos um web.xml para aplicativos WD de ess/mss.
Por favor, aconselhe.
Praveen