Olá JMC
Existem muitas variáveis que devem ser consideradas.
1) Verificar se no seu caso existem BADIs ativas ou pontos de aprimoramento no código que possam afetar esse cálculo ou até mesmo regras próprias que tenham afetado os conceitos que você mencionou (/4xxs).
2) Certificar-se de que o cálculo manual realizado não considera o subsídio ao emprego Bruto (/484) concedido durante todo o ano e que não o considera como parte das bases.
Considero que os passos a seguir são os seguintes:
1) Realize o teste de cálculo com um AJ02 no modo de teste usando Off cycle e verifique se os resultados fornecidos pelo SAP não mudam.
2) Se os resultados não mudarem, significa que a configuração na tabela 3 está correta, portanto, você deverá começar a depurar o que o sistema está fazendo.
Para a leitura dos acumulados, coloque um breakpoint no formulário OBT_ACUMS_ANUAIS do programa PCISMMX0, é um bom ponto de partida para começar e ver o que está sendo colocado em cada parte do cálculo.
Saudações
Amilcar