Hola JMC
Pues existen muchas variables que se deben tener en cuenta.
1) Verificar si en tu caso existen BADIS activas o enhancement points en el código que puedan afectar este cálculo o incluso reglas propias que hayan afectado los conceptos que te mencioné (/4xxs).
2) Que el cálculo manual que se realiza no tome en cuenta el subsidio al empleo Bruto (/484) que se otorgó durante todo el año, y que no lo considere como parte de las bases.
Considero que los pasos a seguir son los siguientes:
1) Realiza la prueba de cálculo con un AJ02 en modo test utilizando Off cycle y verifica si los resultados que arroja SAP no cambian.
2) Si los resultados no cambian, significa que la configuración en la tabla 3 es correcta, por lo tanto, deberás empezar a depurar qué está haciendo el sistema.
Para la lectura de acumulados, coloca un breakpoint en el formulario OBT_ACUMS_ANUALES del programa PCISMMX0, es un buen punto de partida para comenzar y ver qué se coloca en cada parte del cálculo.
Saludos
Amilcar