Resolvi o problema copiando os arquivos do kernel para o diretório /sapmnt/
De acordo com a nota 2473836 - Erro em PHASE PREP_INPUT_CHECK/KX_CPYORG ao realizar uma atualização com o Software Update Manager, verifiquei se o DIR_CT_RUN está configurado corretamente, então copiei os arquivos do kernel de /sapmnt/
cdpro
grep DIR_CT_RUN
DIR_CT_RUN = $(DIR_EXE_ROOT)$(DIR_SEP)$(OS_UNICODE)$(DIR_SEP)linuxx86_64
grep DIR_CT_RUN
DIR_CT_RUN = $(DIR_EXE_ROOT)$(DIR_SEP)$(OS_UNICODE)$(DIR_SEP)linuxx86_64
Lendo parâmetros de perfil de '/usr/sap/install_EOW/SUM/abap/log/EOW_DVEBMGS10_EBCL08V002.PPR'.
3WETQ399 Parâmetro de perfil 'Start_Program_*' não encontrado.
3 ETQ399 Lendo parâmetros de perfil de '/usr/sap/install_EOW/SUM/abap/log/EOW_DVEBMGS10_EBCL08V002.PPR'.
3 ETQ399 Valor de perfil recuperado 'Execute_*' como 'imediato /usr/sap/EOW/SYS/exe/uc/linuxx86_64/sapcpe pf=/usr/sap/EOW/SYS/profile/EOW_DVEBMGS10_ebcl08v002'.
3 ETQ399 Lendo parâmetros de perfil de '/usr/sap/install_EOW/SUM/abap/log/EOW_DVEBMGS10_EBCL08V002.PPR'.
3 ETQ399 Valor de perfil recuperado 'DIR_CT_RUN' como '/usr/sap/EOW/SYS/exe/uc/linuxx86_64'.