Olá!
O Motor de Adaptação é um componente em J2EE que lida com a comunicação entre diferentes sistemas técnicos. Todos os adaptadores (exceto HTTP e IDoc) são colocados aqui. É baseado em JAVA.
O motor de integração é o motor principal (ABAP), que processa coisas como o roteamento de mensagens, etc. É baseado em ABAP.
Não é exatamente uma boa imagem, mas verifique:
http://help.sap.com/saphelp_nw04s/helpdata/en/45/17be55967e4574e10000000a114a6b/frameset.htm
Peter