Como verificar se é seguro atualizar o Java em servidores BOE com plataforma BI 4.2 sp06?

Sua plataforma de BI utiliza o SAP Java fornecido pela SAP como parte do pacote de instalação. Ele é atualizado através do processo regular de manutenção da SAP (SPs e patches). O 4.2 Sp6 vem com o SAP Java 8.1.030, que é baseado no 8u131 da Oracle.

O Java que você mencionou parece ser o JRE/JDK da Oracle que você instalou separadamente.
Nesse caso, você pode atualizá-lo se desejar, pois não é utilizado na plataforma.