Hola Roberto:
Soy usuario de SBO, por lo tanto, mi respuesta puede no ser satisfactoria para ti, pero según lo que veo, el SBO no permite documentos con un valor de 0, siempre deben tener al menos una cantidad mínima de .01 (así fue programado).
En cuanto a las notas de crédito vinculadas a una factura en los pagos recibidos (que más bien se seleccionan en el mismo documento de pago, ya que esto no genera una reconciliación automática), creo que tiene sentido, ya que debe haber algún importe de pago asociado a esa factura. Si la nota de crédito es por el total de la factura, sería mejor crear la nota de crédito copiando la factura, de esta forma desaparecería de los documentos pendientes por cobrar y no sería necesario realizar esa tediosa reconciliación posteriormente.
Espero que esta explicación te sea útil y hasta que SAP cambie su programación a como estamos acostumbrados a pensar, tendremos que trabajar de esta manera.
