O processo que conheço e utilizo para o SAP BO 2007 é o seguinte:
Gestão de bancos
Extratos bancários e conciliações externas
Tratar extratos bancários externos (selecione a conta contábil do banco que deseja conciliar e este módulo carrega os dados do banco, como extrato, débitos e créditos. Tenha cuidado, pois o débito em um banco é um crédito para a contabilidade. Inclui datas e saldos finais, sendo uma cópia idêntica ao extrato bancário).
Depois de carregar o extrato bancário com saldos finais idênticos (extrato bancário com o SAP), só resta fazer a conciliação. Para isso, utilize o módulo de Conciliação. Em seguida, selecione a conta contábil do banco (a mesma em que carregou o extrato bancário). Aparecerão três módulos: Manual (não recomendado se houver muita movimentação na conta), Automático (pode ser usado se estiver relacionado a alguma referência entre o SAP, como totais ou número de cheque) e Semiautomático. Por último, insira a data para a qual deseja conciliar. Depois de selecionar tudo isso e clicar em Conciliar, uma tela dividida em quatro partes aparecerá para iniciar a conciliação. No canto superior esquerdo, são exibidos os dados contábeis (por exemplo, cheques, notas de débito e crédito, depósitos, etc.), e no canto superior direito é exibido o extrato bancário (o carregado no módulo de Tratar extratos bancários externos). Para conciliar, selecione um cheque (por exemplo) do lado contábil dando um duplo clique nele ou selecionando-o com as datas exibidas entre as quatro telas. Por último, selecione "conciliar" e pronto, você está conciliando.
Por fim, basta criar um layout para visualizar o resultado final da conciliação.
Espero que esta explicação seja útil para você, e se alguém conhecer outro método, espero que possam compartilhar.
Saudações
