¿Estás seguro de que el archivo de configuración se está leyendo correctamente?
¿Has especificado el archivo de configuración de log4j en tu web.xml?
<web-app id="WebApp">
<display-name>anyApplic</display-name>
<servlet>
<servlet-name>Log4jInit</servlet-name>
<display-name>Log4jInit</display-name>
<servlet-class>de.myProject.tools.log4j.Log4jInit</servlet-class>
<init-param>
<param-name>log4j-init-file</param-name>
<param-value>/WEB-INF/log4j.lcf</param-value>
</init-param>
<load-on-startup>1</load-on-startup>
</servlet>