Hola Manish,
Según mi conocimiento, no restringirá ninguna de las funcionalidades estándar.
Con PI restringe porque solo puedes crear órdenes de producción y no órdenes de procesos.
AFS actúa como un complemento en lugar de una funcionalidad separada. Estoy trabajando con ECC 6 estándar con AFS 6.3 y hasta ahora AFS no ha creado ninguna restricción en la funcionalidad estándar.
SAP no ha publicado ninguna documentación al respecto.
Si aún tienes alguna duda, hazme saber.
Saludos,
Vishal