Hola,
Las tablas de configuración se utilizan en la extracción de LO, cuando se está extrayendo datos usando LO como carga completa o carga inicial, en ese momento solo necesitamos llenar las tablas de configuración en el lado de R/3, para todas las demás cargas delta los datos vendrán de la cola delta.
Intenta buscar en el foro con el objeto de búsqueda como tablas de configuración, obtendrás mucha información.